–FET y de las JONS. Documentación en proceso de identificación y descripción, años extremos aproximados 1939-1975.
–Cámara Agraria. Recoge la documentación de esta institución heredera de la Hermandad Sindical de Labradores y Ganaderos. En proceso de identificación, segunda mitad del siglo XX.
–Sociedad de Campesinos de San Juan de Alicante. Actas y registro de socios de 1937-1938.
–Sociedad de Agricultores La Unión UGT. Listado de afiliados de 1936-1938.
–Colegio Público Cristo de la Paz. Documentación de la segunda mitad del siglo XX, en proceso de clasificación y descripción.
–Fondo gráfico Adolfo Castillo Morcillo. Fotografías de actos culturales y festivos, civiles y religiosos, tomadas entre 2001 y 2006, pendiente de tratamiento archivístico.
–Colección Martínez-Mena. El jurista Miguel Martínez-Mena (1917-2008) fue el último propietario de la finca “Pedro José”, adquirida por el ayuntamiento en 2006. En su interior se encontraba una colección documental de diversas temáticas (Orden de San Juan de Dios, Santa Faz, Transición y temas alicantinos y locales), así como libros y publicaciones periódicas que fueron a parar al AMSJA. Las fechas extremas van desde 1709 a 1992.
–Cuenta asimismo el AMSJA con otras imprtantes donaciones y depósitos tanto de personas como de instituciones y asociaciones:
- Penya Els Penjats
- Sociedad Ciclista Sant Joan
- Asociación Cultural Lloixa
- Grupo Fotográfico Sant Joan
- Sociedad Musical La Paz
- Comisión de Fiestas Cristo de la Paz
- Sección Adoradora Nocturna
